Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl29P47915 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms