Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtbP41155 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LtbP41155 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LtbP41155 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtbP41155 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbP41155 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbP41155 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbP41155 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbP41155 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbP41155 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbP41155 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LtbP41155 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbP41155 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms