Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fen1P39749 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fen1P39749 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fen1P39749 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms