Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpargP37238 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpargP37238 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpargP37238 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PpargP37238 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PpargP37238 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpargP37238 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpargP37238 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpargP37238 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PpargP37238 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PpargP37238 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms