Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab5cP35278 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab5cP35278 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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