Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp4P35123 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms