Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc3P33622 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms