Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcdP28867 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcdP28867 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms