Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp3P28862 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp3P28862 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms