Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BgnP28653 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BgnP28653 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BgnP28653 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BgnP28653 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BgnP28653 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BgnP28653 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BgnP28653 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BgnP28653 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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