Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LoxP28301 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LoxP28301 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LoxP28301 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LoxP28301 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LoxP28301 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LoxP28301 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LoxP28301 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LoxP28301 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LoxP28301 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LoxP28301 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms