Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NdnP25233 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NdnP25233 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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NdnP25233 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NdnP25233 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NdnP25233 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NdnP25233 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NdnP25233 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NdnP25233 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NdnP25233 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NdnP25233 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NdnP25233 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NdnP25233 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NdnP25233 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NdnP25233 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NdnP25233 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NdnP25233 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NdnP25233 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NdnP25233 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NdnP25233 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NdnP25233 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NdnP25233 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NdnP25233 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NdnP25233 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NdnP25233 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NdnP25233 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NdnP25233 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NdnP25233 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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NdnP25233 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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