Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd3eP22646 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms