Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms