Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VimP20152 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VimP20152 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VimP20152 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VimP20152 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VimP20152 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VimP20152 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VimP20152 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VimP20152 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VimP20152 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VimP20152 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VimP20152 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VimP20152 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VimP20152 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VimP20152 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VimP20152 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VimP20152 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VimP20152 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VimP20152 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VimP20152 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VimP20152 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VimP20152 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VimP20152 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VimP20152 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VimP20152 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VimP20152 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VimP20152 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VimP20152 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VimP20152 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VimP20152 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VimP20152 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms