Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps6ka3P18654 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka3P18654 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms