Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb1P17919 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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