Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prph2P15499 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prph2P15499 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms