Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms