Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CatspereP0DP43 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatspereP0DP43 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms