Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms