Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms