Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna9P09235 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms