Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtrP07309 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TtrP07309 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TtrP07309 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtrP07309 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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TtrP07309 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtrP07309 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TtrP07309 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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