Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01663 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01663 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01663 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01663 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01663 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01663 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01663 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01663 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01663 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01663 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01663 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01663 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01663 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01663 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01663 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01663 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01663 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01663 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01663 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01663 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms