Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01660 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01660 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01660 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01660 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01660 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01660 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01660 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01660 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01660 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01660 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01660 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01660 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01660 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01660 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01660 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01660 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01660 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01660 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01660 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01660 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01660 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms