Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms