Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sema6bO54951 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms