Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CrxO54751 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CrxO54751 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CrxO54751 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CrxO54751 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CrxO54751 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CrxO54751 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CrxO54751 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CrxO54751 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CrxO54751 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CrxO54751 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CrxO54751 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CrxO54751 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CrxO54751 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CrxO54751 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CrxO54751 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CrxO54751 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CrxO54751 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms