Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms