Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc1O35379 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms