Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Nedd9O35177 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Nedd9O35177 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Nedd9O35177 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Nedd9O35177 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Nedd9O35177 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Nedd9O35177 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Nedd9O35177 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Nedd9O35177 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Nedd9O35177 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd9O35177 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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