Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms