Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm2035J3QP87 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm2035J3QP87 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms