Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20918J3QN17 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20918J3QN17 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms