Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21060J3KMU4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms