Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r58G3X9U3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms