Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933408B17RikG3X9B4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms