Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp846G3X996 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms