Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid4aF8VPQ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid4aF8VPQ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid4aF8VPQ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid4aF8VPQ2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid4aF8VPQ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid4aF8VPQ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid4aF8VPQ2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid4aF8VPQ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms