Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm10378F6XQQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm10378F6XQQ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Gm10378F6XQQ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Gm10378F6XQQ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm10378F6XQQ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm10378F6XQQ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm10378F6XQQ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Gm10378F6XQQ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm10378F6XQQ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm10378F6XQQ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm10378F6XQQ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm10378F6XQQ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm10378F6XQQ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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