Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Raph1F2Z3U3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms