Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Cdh18E9Q9Q6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Cdh18E9Q9Q6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdh18E9Q9Q6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms