Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms