Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Zfp558E9Q1J0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Zfp558E9Q1J0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Zfp558E9Q1J0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Zfp558E9Q1J0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Zfp558E9Q1J0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp558E9Q1J0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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