Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gcom1E9PZ54 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms