Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgaE9PV24 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgaE9PV24 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FgaE9PV24 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FgaE9PV24 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms