Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif28pD3YXS5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif28pD3YXS5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif28pD3YXS5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif28pD3YXS5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif28pD3YXS5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif28pD3YXS5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms