Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc170D3YXL0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms