Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rexo5D3YW29 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo5D3YW29 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms